پذیرش کارشناسی ارشد علوم و مهندسی آب در دانشگاه‌های سراسری و دانشگاه آزاد صورت می‌گیرد. ظرفیت پذیرش در این رشته به صورت جداگانه در دو دفترچه انتخاب رشته ارشد سراسری و دانشگاه آزاد اطلاع‌رسانی می‌شود.
بر اساس دفترچه ثبت نام کنکور ارشد، در رشته علوم و مهندسی آب در گرایش‌های زیر دانشجوی کارشناسی ارشد پذیرفته می‌شود:
۱) علوم و مهندسی آب (آبیاری و زهکشی، سازه‌های آبی، رودخانه و اکوسیستم های آبی، منابع آب، مدیریت و برنامه ریزی منابع آب، هواشناسی کشاورزی، هیدرو انفورماتیک)
۲) مهندسی طبیعت
داوطلبان گرایش‌های مختلف این رشته لازم است در آزمون کارشناسی ارشد مجموعه علوم و مهندسی آب نموده و با توجه به ضرایب دروس امتحانی کنکور کارشناسی ارشد علوم و مهندسی آب، نسبت به کسب آمادگی برای آزمون اقدام نمایند.
در کارنامه اولیه اعلام نتایج کنکور کارشناسی ارشد، به هر یک از گرایش‌های فوق یک کدضریب اختصاص داده شده (که در دفترچه انتخاب رشته ارشد نیز قابل مشاهده است) و رتبه داوطلب برای هر یک از این گرایش‌ها با توجه به ضریب درنظرگرفته شده برای هر یک از دروس امتحانی اعلام می‌شود.
جهت مشاهده ظرفیت پذیرش کارشناسی ارشد علوم و مهندسی آب به لینک زیر در سایت مسترتست مراجعه کنید:
https://mastertest.ir/1396/01/%d8%b8%d8%b1%d9%81%db%8c%d8%aa-%d8%a7%d8%b1%d8%b4%d8%af-%d8%b9%d9%84%d9%88%d9%85-%d9%85%d9%87%d9%86%d8%af%d8%b3%db%8c-%d8%a2%d8%a8-97-98/
