علاوه بر مزایایی که برای وودمارت در نظر گرفته می شود، معمولا معایبی نیز وجود دارند که در برخی قابلیت ها و نسخه های آن خود را نشان می دهند. به عنوان مثال در بعضی از هاست ها سرعت پایین وجود داشت یا اینکه در هدر ساز اغلب مشکل به وجود می آمد که باعث کندی در سرعت سایت می شد.
هم چنین گاهی فونت ها و آیکن ها بارگذاری نمی شدند که این موضوع ممکن بود بازدید سایت را پایین بیاورد. اما با بروز هر گونه مشکل در قالب وودمارت که به عنوان معایب آن در نظر گرفته می شود، یک آپدیت و رفع مشکل از طرف سازنده منتشر خواهد شد تا عیبی برای وودمارت وجود نداشته باشد. برای اینکه بتوانید از پشتیبانی قالب وودمارت استفاده کنید و با به روز کردن آن معایب موجود را از بین ببرید، بهتر است تا نسخه اورجینال آن را خریداری کنید. در این صورت می توان به راحتی از آپدیت ها استفاده کنید. اما نسخه ها کاملا رایگان این امکانات را ندارند.
