در زمان حکومت ناصر الدین شاه بعد از اینکه از سفر به فرنگ بازگشتند در قسمت جنوبی باغ مدرسه مستظرفه را بنا نهادند. در سال 1307 با گذشت زمان این باغ به عنوان باغ های سلطنتی کاربری نداشت و به وزارت معرفت و دارالمعلمین اختصاص داده شد.
برای این کار سه بنای بزرگ را احداث کردند که معمار آن الکسی مارک و مهاجر روس بودند. بعد از آن در سال 1311 به دست سید علی اکبر باغبان دبیرستان علمیه را بنا نهادند. کتابخانه باغ نگارستان در سال 1325 احداث شد که پروین اعتصامی معاونت آن را بر عهده داشت و در سال 1335 موسسه لغت نامه دهخدا ، کلاس های زبان، جغرافیا و کلاس های عمومی دانشگاه را بر گزار می کردند.
