بنایی که در حال حاضر به عنوان معبد داش کسن وجود دارد حدود 700 سال پیش یعنی در دوره ایلخانیان ساخته شده است. در آن زمان الجای خاتون خواهر سلطان محمد خدابنده پس از مرگ ارغون شاه مغول دستور داد که این بنا احداث شود.
متاسفانه ساخت این معبد هیچگاه به اتمام نرسید و نیمه کاره باقی ماند. علت این موضوع و به اتمام نرسیدن آن مشخص نیست اما گروهی از مورخان معتقد هستند که چون پیش از مسلمان شدن شاه مغول دستور ساخت آن صادر شده با روی کار آمدن حکومت مسلمان ایلخانان ساخت آن را متوقف کرده اند و مانع از ادامه ساخت معبد شده اند.